Comparison of methods for relative quantification of gene expression using real-time PCR
Primerjava metod za relativno kvantifikacijo genskega izražanja s PCR v realnem času

angleški

2012

letnik 100, številka 2

molekularna genetika   geni    gensko izražanje   kvantitativni PCR v realnem času   metode

Univerza v Ljubljani, Biotehniška fakulteta
(Obvezni izvod spletne publikacije)

Metoda kvantitativne verižne reakcije s polimerazo v realnem času (qPCR) je postala najpogosteje uporabljen način analize izražanja genov. Razvitih je bilo več metod za relativno kvantifikacijo genske ekspresije, ki omogočajo hitro in zanesljivo detekcijo ter kvantifikacijo specifičnih nukleinskih kislin. Mednje spadajo: metoda z umeritveno krivuljo, metoda z upoštevanjem učinkovitosti pomnoževanja in metoda po enačbi 2-deltadeltaCq. V tej študiji smo z analizirajem izražanja gena MS53_0284, ki kodira nukleazo pri bakteriji Mycoplasma synoviae WVU 1853, po okužbi celic CEC-32 in vitro s qPCR preverili primerljivost rezultatov, dobljenih z uporabo omenjenih metod. Pokazali smo, da z upoštevanjem potrebnih pogojev z omenjenimi metodami pridobimo primerljive rezultate ter da sta metoda z umeritveno krivuljo in metoda z upoštevanjem učinkovitosti pomnoževanja primernejši za ugotavljanje majhnih razlik v izražanju genov kot metoda po enačbi 2-deltadeltaCq.

11.06.2013